Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRPPRCP42704 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms