Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NF2P35240 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NF2P35240 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NF2P35240 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NF2P35240 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NF2P35240 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NF2P35240 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NF2P35240 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NF2P35240 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF2P35240 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF2P35240 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF2P35240 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF2P35240 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF2P35240 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF2P35240 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF2P35240 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF2P35240 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF2P35240 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF2P35240 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF2P35240 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF2P35240 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NF2P35240 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF2P35240 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NF2P35240 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF2P35240 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF2P35240 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF2P35240 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF2P35240 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NF2P35240 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF2P35240 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF2P35240 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF2P35240 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF2P35240 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF2P35240 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NF2P35240 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NF2P35240 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NF2P35240 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms