Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP6P35125 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP6P35125 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP6P35125 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP6P35125 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP6P35125 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP6P35125 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP6P35125 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP6P35125 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP6P35125 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP6P35125 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP6P35125 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP6P35125 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP6P35125 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP6P35125 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP6P35125 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP6P35125 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP6P35125 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP6P35125 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP6P35125 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP6P35125 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP6P35125 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP6P35125 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP6P35125 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP6P35125 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP6P35125 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP6P35125 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP6P35125 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP6P35125 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP6P35125 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP6P35125 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP6P35125 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP6P35125 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP6P35125 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP6P35125 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP6P35125 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP6P35125 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP6P35125 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP6P35125 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP6P35125 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP6P35125 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP6P35125 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP6P35125 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP6P35125 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP6P35125 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP6P35125 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP6P35125 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP6P35125 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP6P35125 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP6P35125 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP6P35125 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP6P35125 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP6P35125 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP6P35125 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP6P35125 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP6P35125 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP6P35125 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP6P35125 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP6P35125 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP6P35125 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP6P35125 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP6P35125 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP6P35125 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP6P35125 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP6P35125 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP6P35125 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP6P35125 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP6P35125 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP6P35125 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP6P35125 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP6P35125 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP6P35125 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP6P35125 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP6P35125 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP6P35125 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP6P35125 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP6P35125 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP6P35125 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP6P35125 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP6P35125 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP6P35125 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP6P35125 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP6P35125 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6P35125 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6P35125 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6P35125 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6P35125 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6P35125 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6P35125 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6P35125 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6P35125 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6P35125 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6P35125 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6P35125 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6P35125 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6P35125 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6P35125 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6P35125 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6P35125 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6P35125 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms