Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms