Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms