Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD34P28906 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms