Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLD1P28340 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLD1P28340 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLD1P28340 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLD1P28340 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLD1P28340 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLD1P28340 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLD1P28340 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLD1P28340 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLD1P28340 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLD1P28340 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLD1P28340 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLD1P28340 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLD1P28340 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLD1P28340 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLD1P28340 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLD1P28340 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLD1P28340 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLD1P28340 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLD1P28340 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLD1P28340 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLD1P28340 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLD1P28340 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLD1P28340 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLD1P28340 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLD1P28340 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLD1P28340 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLD1P28340 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLD1P28340 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLD1P28340 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLD1P28340 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLD1P28340 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLD1P28340 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLD1P28340 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLD1P28340 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLD1P28340 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLD1P28340 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLD1P28340 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLD1P28340 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLD1P28340 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD1P28340 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD1P28340 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD1P28340 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD1P28340 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD1P28340 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD1P28340 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD1P28340 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD1P28340 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD1P28340 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD1P28340 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD1P28340 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD1P28340 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD1P28340 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD1P28340 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD1P28340 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD1P28340 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD1P28340 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD1P28340 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD1P28340 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD1P28340 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD1P28340 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD1P28340 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD1P28340 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD1P28340 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD1P28340 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD1P28340 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD1P28340 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD1P28340 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD1P28340 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD1P28340 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD1P28340 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD1P28340 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD1P28340 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD1P28340 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD1P28340 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD1P28340 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD1P28340 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD1P28340 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD1P28340 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD1P28340 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD1P28340 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD1P28340 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD1P28340 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD1P28340 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD1P28340 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD1P28340 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLD1P28340 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLD1P28340 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD1P28340 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD1P28340 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD1P28340 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.5 ms