Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms