Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA5P28066 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms