Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms