Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PLNP26678 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PLNP26678 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PLNP26678 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PLNP26678 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PLNP26678 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PLNP26678 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PLNP26678 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PLNP26678 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PLNP26678 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PLNP26678 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PLNP26678 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PLNP26678 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PLNP26678 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PLNP26678 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PLNP26678 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PLNP26678 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PLNP26678 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PLNP26678 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PLNP26678 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PLNP26678 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PLNP26678 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PLNP26678 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PLNP26678 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PLNP26678 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PLNP26678 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PLNP26678 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PLNP26678 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PLNP26678 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PLNP26678 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PLNP26678 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PLNP26678 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PLNP26678 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PLNP26678 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PLNP26678 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PLNP26678 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PLNP26678 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PLNP26678 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PLNP26678 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PLNP26678 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PLNP26678 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PLNP26678 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PLNP26678 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms