Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms