Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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