Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms