Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms