Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRHP20396 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRHP20396 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRHP20396 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRHP20396 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRHP20396 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRHP20396 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRHP20396 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRHP20396 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRHP20396 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRHP20396 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRHP20396 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRHP20396 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRHP20396 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRHP20396 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRHP20396 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRHP20396 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRHP20396 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRHP20396 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRHP20396 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRHP20396 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRHP20396 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRHP20396 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRHP20396 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TRHP20396 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRHP20396 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRHP20396 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRHP20396 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TRHP20396 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TRHP20396 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRHP20396 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRHP20396 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRHP20396 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRHP20396 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRHP20396 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRHP20396 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRHP20396 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRHP20396 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRHP20396 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRHP20396 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRHP20396 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRHP20396 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRHP20396 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRHP20396 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRHP20396 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRHP20396 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRHP20396 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRHP20396 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRHP20396 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRHP20396 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRHP20396 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRHP20396 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRHP20396 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRHP20396 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRHP20396 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRHP20396 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRHP20396 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRHP20396 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRHP20396 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRHP20396 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRHP20396 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRHP20396 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRHP20396 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRHP20396 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRHP20396 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRHP20396 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRHP20396 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRHP20396 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRHP20396 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRHP20396 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRHP20396 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRHP20396 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRHP20396 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRHP20396 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRHP20396 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRHP20396 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRHP20396 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TRHP20396 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRHP20396 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRHP20396 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRHP20396 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TRHP20396 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TRHP20396 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRHP20396 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRHP20396 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRHP20396 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRHP20396 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRHP20396 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRHP20396 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TRHP20396 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRHP20396 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRHP20396 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRHP20396 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRHP20396 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRHP20396 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRHP20396 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRHP20396 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRHP20396 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRHP20396 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRHP20396 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms