Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms