Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT1P17948 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FLT1P17948 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FLT1P17948 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FLT1P17948 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FLT1P17948 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FLT1P17948 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FLT1P17948 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FLT1P17948 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FLT1P17948 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FLT1P17948 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FLT1P17948 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FLT1P17948 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FLT1P17948 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FLT1P17948 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FLT1P17948 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FLT1P17948 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FLT1P17948 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FLT1P17948 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FLT1P17948 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FLT1P17948 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FLT1P17948 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FLT1P17948 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FLT1P17948 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FLT1P17948 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FLT1P17948 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FLT1P17948 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FLT1P17948 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FLT1P17948 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FLT1P17948 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FLT1P17948 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FLT1P17948 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FLT1P17948 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.33■■□□□ 1
FLT1P17948 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FLT1P17948 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FLT1P17948 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FLT1P17948 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FLT1P17948 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FLT1P17948 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FLT1P17948 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FLT1P17948 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FLT1P17948 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms