Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms