Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms