Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREB1P16220 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CREB1P16220 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CREB1P16220 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CREB1P16220 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CREB1P16220 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CREB1P16220 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CREB1P16220 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CREB1P16220 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms