Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRIM27P14373 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms