Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms