Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3P10147 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCL3P10147 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms