Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI4P10075 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI4P10075 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GLI4P10075 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GLI4P10075 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GLI4P10075 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GLI4P10075 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GLI4P10075 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GLI4P10075 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GLI4P10075 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GLI4P10075 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GLI4P10075 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms