Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GLI2P10070 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI2P10070 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI2P10070 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI2P10070 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI2P10070 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI2P10070 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI2P10070 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI2P10070 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI2P10070 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI2P10070 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI2P10070 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI2P10070 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI2P10070 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI2P10070 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI2P10070 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GLI2P10070 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI2P10070 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI2P10070 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI2P10070 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI2P10070 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI2P10070 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI2P10070 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI2P10070 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI2P10070 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI2P10070 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI2P10070 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI2P10070 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI2P10070 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI2P10070 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI2P10070 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI2P10070 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI2P10070 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI2P10070 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI2P10070 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI2P10070 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI2P10070 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI2P10070 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI2P10070 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI2P10070 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI2P10070 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI2P10070 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GLI2P10070 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI2P10070 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI2P10070 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI2P10070 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI2P10070 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI2P10070 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI2P10070 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI2P10070 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI2P10070 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI2P10070 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI2P10070 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI2P10070 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI2P10070 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI2P10070 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI2P10070 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI2P10070 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI2P10070 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI2P10070 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI2P10070 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI2P10070 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GLI2P10070 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLI2P10070 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLI2P10070 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLI2P10070 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLI2P10070 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLI2P10070 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLI2P10070 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GLI2P10070 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLI2P10070 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLI2P10070 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLI2P10070 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLI2P10070 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLI2P10070 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GLI2P10070 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI2P10070 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI2P10070 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI2P10070 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI2P10070 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI2P10070 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI2P10070 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI2P10070 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI2P10070 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI2P10070 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI2P10070 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI2P10070 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI2P10070 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI2P10070 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI2P10070 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI2P10070 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI2P10070 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI2P10070 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI2P10070 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI2P10070 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI2P10070 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GLI2P10070 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GLI2P10070 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GLI2P10070 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GLI2P10070 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms