Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms