Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSLP07711 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSLP07711 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSLP07711 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSLP07711 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSLP07711 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSLP07711 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSLP07711 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSLP07711 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSLP07711 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSLP07711 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSLP07711 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSLP07711 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSLP07711 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSLP07711 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSLP07711 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSLP07711 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSLP07711 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSLP07711 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSLP07711 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSLP07711 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSLP07711 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSLP07711 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms