Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TYMSP04818 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TYMSP04818 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms