Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB1P04280 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRB1P04280 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRB1P04280 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRB1P04280 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRB1P04280 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB1P04280 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB1P04280 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB1P04280 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB1P04280 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms