Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D2O95562 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D2O95562 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D2O95562 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D2O95562 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D2O95562 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D2O95562 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D2O95562 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D2O95562 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D2O95562 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D2O95562 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D2O95562 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D2O95562 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D2O95562 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D2O95562 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D2O95562 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D2O95562 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D2O95562 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D2O95562 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D2O95562 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D2O95562 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D2O95562 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D2O95562 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D2O95562 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D2O95562 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D2O95562 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D2O95562 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D2O95562 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D2O95562 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D2O95562 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D2O95562 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D2O95562 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D2O95562 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D2O95562 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms