Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPBO95292 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPBO95292 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPBO95292 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPBO95292 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPBO95292 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPBO95292 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPBO95292 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPBO95292 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPBO95292 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPBO95292 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPBO95292 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPBO95292 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPBO95292 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPBO95292 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPBO95292 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPBO95292 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPBO95292 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPBO95292 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPBO95292 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPBO95292 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPBO95292 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPBO95292 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPBO95292 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPBO95292 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPBO95292 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPBO95292 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPBO95292 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPBO95292 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPBO95292 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPBO95292 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPBO95292 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPBO95292 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPBO95292 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPBO95292 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPBO95292 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPBO95292 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPBO95292 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPBO95292 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPBO95292 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPBO95292 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPBO95292 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPBO95292 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPBO95292 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPBO95292 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPBO95292 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPBO95292 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPBO95292 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPBO95292 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPBO95292 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPBO95292 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPBO95292 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPBO95292 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPBO95292 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPBO95292 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPBO95292 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPBO95292 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAPBO95292 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAPBO95292 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAPBO95292 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAPBO95292 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAPBO95292 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAPBO95292 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAPBO95292 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAPBO95292 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAPBO95292 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAPBO95292 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAPBO95292 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAPBO95292 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAPBO95292 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAPBO95292 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAPBO95292 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAPBO95292 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VAPBO95292 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAPBO95292 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAPBO95292 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VAPBO95292 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAPBO95292 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms