Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms