Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPLO60437 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPLO60437 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPLO60437 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPLO60437 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPLO60437 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPLO60437 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PPLO60437 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPLO60437 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPLO60437 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPLO60437 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPLO60437 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPLO60437 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPLO60437 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPLO60437 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PPLO60437 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPLO60437 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPLO60437 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPLO60437 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPLO60437 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PPLO60437 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPLO60437 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPLO60437 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPLO60437 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPLO60437 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPLO60437 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPLO60437 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPLO60437 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPLO60437 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPLO60437 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPLO60437 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PPLO60437 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPLO60437 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPLO60437 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPLO60437 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPLO60437 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPLO60437 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPLO60437 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPLO60437 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPLO60437 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPLO60437 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPLO60437 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPLO60437 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPLO60437 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPLO60437 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPLO60437 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPLO60437 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPLO60437 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPLO60437 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPLO60437 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PPLO60437 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PPLO60437 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPLO60437 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPLO60437 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPLO60437 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPLO60437 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPLO60437 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPLO60437 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPLO60437 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPLO60437 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPLO60437 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPLO60437 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PPLO60437 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PPLO60437 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPLO60437 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPLO60437 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPLO60437 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPLO60437 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPLO60437 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPLO60437 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPLO60437 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPLO60437 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPLO60437 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPLO60437 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPLO60437 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPLO60437 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPLO60437 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PPLO60437 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPLO60437 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPLO60437 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPLO60437 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPLO60437 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPLO60437 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPLO60437 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPLO60437 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPLO60437 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPLO60437 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPLO60437 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPLO60437 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPLO60437 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPLO60437 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PPLO60437 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPLO60437 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPLO60437 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPLO60437 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPLO60437 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPLO60437 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPLO60437 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPLO60437 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPLO60437 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms