Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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VEGFDO43915 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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VEGFDO43915 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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VEGFDO43915 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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VEGFDO43915 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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VEGFDO43915 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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VEGFDO43915 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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VEGFDO43915 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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VEGFDO43915 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
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VEGFDO43915 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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