Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms