Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms