Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA5O15230 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA5O15230 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms