Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNJ2O15056 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms