Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD1AO15047 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms