Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms