Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf58C9J3I9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf58C9J3I9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf58C9J3I9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf58C9J3I9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf58C9J3I9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf58C9J3I9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf58C9J3I9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf58C9J3I9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf58C9J3I9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf58C9J3I9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf58C9J3I9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf58C9J3I9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf58C9J3I9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf58C9J3I9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf58C9J3I9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf58C9J3I9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C5orf58C9J3I9 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C5orf58C9J3I9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C5orf58C9J3I9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C5orf58C9J3I9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C5orf58C9J3I9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C5orf58C9J3I9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C5orf58C9J3I9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C5orf58C9J3I9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C5orf58C9J3I9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C5orf58C9J3I9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C5orf58C9J3I9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C5orf58C9J3I9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms