Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms