Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms