Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms