Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD3L3A6NE82 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms