Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L4A6NCW7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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