Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSDA5PKW4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSDA5PKW4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.6 ms