Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
EFCAB5A4FU69 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFCAB5A4FU69 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFCAB5A4FU69 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFCAB5A4FU69 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFCAB5A4FU69 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFCAB5A4FU69 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFCAB5A4FU69 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFCAB5A4FU69 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFCAB5A4FU69 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFCAB5A4FU69 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFCAB5A4FU69 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFCAB5A4FU69 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFCAB5A4FU69 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFCAB5A4FU69 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFCAB5A4FU69 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFCAB5A4FU69 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFCAB5A4FU69 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFCAB5A4FU69 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFCAB5A4FU69 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFCAB5A4FU69 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFCAB5A4FU69 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms