Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAMTA1Q9Y6Y1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms